Ada dua hal yang dikembangkan dalam keorganisasian ini yaitu di tingkat perkumpulan dan di tingkat sekretariat atau kantor.

• Di tingkat perkumpulan  adalah penguatan keanggotaan, memperkokoh visi, misi, dan strategi KAPAL Perempuan sebagai bagian dari gerakan sosial dan gerakan perempuan. 
• Di tingkat sekeretariat atau kantor adalah mengembangkan manajemen organisasi yang memberikan pelayanan publik yang mampu menjawab kebutuhan, cepat, akuntabel dan transparan kepada internal KAPAL Perempuan dan masyarakat luas. Beberapa kegiatan yang dilakukan antara lain mengembangkan perpustakaan yang dapat diakses oleh publik, pendokumentasian melalui Management Information System (MIS), hubungan masyarakat dan jaringan, memberikan dukungan pengembangan kapasitas organisasi dengan memfasilitasi strategic planning, pelatihan dan kursus pendokumentasian, keuangan, penulisan dan memperkuat perspektif keadilan gender.